Здравствуйте, ст. 81 ТК РФ: Трудовой договор может быть расторгнут работодателем в случаях:
1) ликвидации организации, либо прекращения деятельности индивидуальным предпринимателем
Вы имеете право декретницу уволить, но прежде сделать выплаты, т.к. она у вас в штате и принесла уже больничный лист, а ваше ИП не было на стадии закрытия, ликвидации.
В соответствии с ч. 6 ст. 81 Трудового кодекса РФ не допускается увольнение работника по инициативе работодателя (за исключением случая ликвидации организации либо прекращения деятельности индивидуальным предпринимателем) в период его временной нетрудоспособности и в период пребывания в отпуске.
В данном случае имеете право уволить работника по собственной инициативе, основанием для увольнения будет ликвидация индивидуального предпринимателя.